用Sequin向NCBI提交序列

Sequin下载

（下载页面：http://www.ncbi.nlm.nih.gov/Sequin/index.html）

Sequin介绍

1. 提交的是批量而且比较复杂的序列
2. you are submitting mutation, phylogenetic, population, environmental, or segmented sets
3. 喜欢图形的界面，有更多选项和功能，可以批量修改
4. 获得相关的分析工具
5. 随时可以保存

Sequin提交序列图解教程

1，Sequin开始界面

开始一个新的提交或是选择编辑已有保存的文件（Read Existing Record），用Sequin的好处就是你可以保存下来，可以随时修改。直到满意后再向NCBI提交。

2，输入Title，作者，联系方式等

Title是必须的。自行添写一个。然后点Next Page到Contact菜单，添加联系方式。再Next Page，填写作者等。能填写的就填上，越详细当然是越好的。不知道的话可以跳过，因为后面也是可以重新修改的。

3，添加序列

准备一个Fasta格式的序列。保存在一个文件。可以选择单个序列或是批量序列。其它的Type都是比较特殊，不常见。

4，添加序列的注释信息

 上传了序列之后，点击Next Page继续添加序列的信息，如属于哪个物种的，序列注释。有没有蛋白序列等。这里也是一样，能填的就填上，不懂就Next。后面也是可以修改的。

5，GenBank格式的界面，最后修改

Edit菜单

上面的步骤都完了之后。出现一个GenBank格式的界面，如下图。在这里，一切信息就一目了然。那里不对，需要修改的。双击就行了。另外，在Edit菜单可以修改作者、联系方式等资料。

Annotate菜单

在Annotate菜单可以添加序列的注释，也可以批量添加。如加CDS区，exon区等等。其格式可以参照其它序列的GenBank格式。

6，保存序列

如果在中途要临时保存，在File菜单的Save，保存后的文件是.sqn。全部修改完毕后，选择File/Submission。就会有一个提示框，提示把保存后的发送一封邮件到NCBI。

7，发送邮件提交序列

把保存后的.sqn文件发到gb-sub@ncbi.nlm.nih.gov。等待几天，NCBI就会有回音。